1985 wurde die Band von Kohmoto Hiroto (Vo.), Mashima Masatoshi (Gu.), Kajiwara Tetsuya (Dr.) und Kawaguchi Junnosuke (Ba.) gegründet. Sehr schnell machten sie sich einen Namen in der Punk Szene Japans, vor allem dank ihrer Lives in diversen Clubs von Tokyo. 1987 brachten The Blue Hearts ihr erstes gleichnamiges Album heraus. Ihr Label Meldac war ein Zusammenschluss mehrerer Firmen, darunter Mitsubishi. Mit diesen bekamen sie Probleme, als sie auf ihrem dritten Album den Anti-Atomkraft Song "Chernobyl" veröffentlichten, da Mitsubishi in dieser Branche tätig war. Anstatt den Song vom Album zu nehmen, trennten sich die vier von ihrem Label. Dieser Disput wurde schnell von den Medien aufgegriffen und verhalf dem Album zu sehr großen Verkaufszahlen, welche die der beiden Vorgänger bei weitem übertrafen.
Fortan mussten sie nicht mehr in kleinen Clubs auftreten, sondern konnten sich über gut besuchte Konzerthallen freuen. 1990 starteten sie den ersten Versuch sich in den USA zu etablieren, der aufgrund von mangelnden Besucherzahlen eher ein Misserfolg war. Auch nachdem sie mehrere Veröffentlichungen ausschließlich für Nordamerika machten, ihre Platten im Radio spielen ließen und von diversen Kritikern gelobt wurden, änderte sich nichts an diesem Zustand. Währendessen wurde ihr viertes Album "Bust waste hip", welches von Warner herausgebracht wurde, ein riesiger Erfolg in ihrem Heimatland.
Nach vier weiteren erfolgreichen Jahren, in denen Shirai Mikio als Support am Keyboard hinzukam, trennten sich The Blue Hearts am 23. Juni 1994. Ihr Last Live, bei dem sich bereits Kajiwara verabschiedete, fand vier Tage davor statt. Junnosuke versprach, dass die verbliebenen drei Hauptmitglieder jeweils Solo Songs komponieren würden, um sie dann auf einer Kompilation herauszubringen. Ob diese jemals erschien, ist nicht bekannt. 2005 erschien aber eine Art Best of, bei dem ihre Songs von aktuellen Künstlern wie Husking Bee neuinterpretiert wurden.
Komoto, Mashima und Shirai gründeten The High Lows, die einen ähnlichen Stil pflegen, jedoch noch mehr mit anderen musikalischen Einflüssen experementieren.
Kajiwara wurde Drummer von The 3Peace die noch heute recht erfolgreich sind.
Kawaguchi ist in die Riege der Manager und Produzenten gegangen, in der er sich um neue Künstler wie die Bands Stripe Effect kümmert.