Музыканты собрались вместе еще в 2001 году, чтобы поучаствовать в школьном фестивале. В ее состав вошли лидер и основной автор текстов Yusuke Koide (вокал, гитара), его друг Shohei Yuasa (гитара), начинающая басистка Shiori Sekine и барабанщик Daisuke Horinouchi. В то время группа называлась Planet, и играли они, в основном, каверы на песни Supercar. После фестиваля ребята решили продолжить заниматься музыкой в качестве хобби.
В апреле 2002 группа начала рассылать свои демо-записи. В компании Toshiba EMI им посоветовали сменить название. Сначала музыканты решили стать просто Base Ball, но гитарист Yuasa сказал, что название будет звучать лучше, если добавить еще одно слово. Так, по воле случая, группа стала называться Base Ball Bear. В июле в Shimokitazawa Garage состоялся их первый концерт.
В ноябре 2003 года Base Ball Bear подписали контракт с инди-лейблом Blitz Pia Records и практически сразу, 29 ноября, выпустили свой первый мини-альбом Yugata Generation. В апреле следующего года вышел их первый сингл Yume is Vision. Практически весь 2004 год музыканты провели в студии, работая над новым материалом.
Первый полноценный альбом группы, получивший название High Color Times, вышел 16 марта 2005. Концерты Base Ball Bear собирали все больше зрителей. Кроме того, Shiori Sekine пригласили на одну из главных ролей в фильм «Linda Linda», саундтрек которому включал несколько песен Base Ball Bear.
В октябре 2005 вышел их второй альбом Band B ni Tsuite. В январе группа подписала контракт с EMI Music Japan. Сразу после этого альбом был переиздан. В обновленную версию вошла новая композиция и несколько старых песен с новыми аранжировками. Летом 2006 музыканты, вместе с Chatmonchy и Snowkel приняли участие в Nyakunyaku Nannyo Summer Tour. 29 октября вышел их первый мейджер-альбом С.
Первый сольный тур под названием Live by the C стартовал весной 2007. В течение года группа выпустила 4 сингла и второй мейджер-альбом Junanasai. Помимо сольных концертов, Base Ball Bear приняли участие в Rock in Japan Festival, B-Pop High School Tour и очередном Nannyo Summer Tour.
В 2008 году группа вернулась к сольным выступлениям: в марте прошел 17-sai Kara Yattemasu Tour. 12 марта состоялся релиз первого DVD, в который вошли 10 видеоклипов команды. Первый сингл 2008 года, Changes, вышел 8 мая, и был использован в аниме «Toshokan Senso» в качестве эндинга. В конце сентября состоялось первое выступление Base Ball Bear в Shibuya C.C. Lemon Hall.
2009 год был для музыкантов невероятно плодотворным: они выпустили 3 сингла, 2 макси-сингла, а осенью – третий полноценный альбом (WHAT IS THE) LOVE & POP?. 3 января 2010 года Base Ball Bear дали концерт в знаменитом зале Nippon Budokan. Поддержать любимую группу пришли около 9000 зрителей. 17 марта 2010 года состоялся двойной релиз – на прилавках появились первый лайв-альбом 1235 и первый концертный DVD LIVE:(THIS IS THE) BASE BALL BEAR. NIPPON BUDOKAN.
