Hello! Projectin tarina alkoi, kun supersuosittu tyttöbändi Morning Musume kehitti sisarprojektin, joka koostui uusista nuorista kyvyistä, joiden oli tarkoitus esiintyä ja työskennellä heidän kanssaan. Uusi ryhmä nimettiin Hello! Projectiksi. Tähän ryhmään Matsuura Aya lauloi tiensä esiintymällä koelaulukilpailussa ja voitti siten itselleen neljännen jäsenen paikan. Tsunkun luotsaama yhtye on kuitenkin enemmän kuin pelkkä popryhmä; se on eräänlainen tähtitehdas joka tuottaa ja "luo" uusia tyttöbändejä.
Pian yhtyeeseen liittymisen jälkeen Aya levytti ja julkaisi debyyttisinglensä Dokki Doki! LOVE Mailin. Single menestyi hyvin, myyden yli 70 000 kappaletta. Sen jälkeen seurasi kolme singleä nopeaan tahtiin; Tropical koishiteru, LOVE namida iro sekä 100 kai no KISS, ennen debyyttialbumin, First Kissin julkaisua uudenvuodenpäivänä 2002. First Kissin julkaisu vahvisti Ayan asemaa yhtenä Hello! Projectin menestyneimmistä ja suosituimmista jäsenistä ja kipusi kolmannelle sijalle Oriconin listalla. Suuri osa Matsuura Ayan suosiosta pohjautuu nuoren naisen miellyttävään persoonaan ja suloiseen ulkonäköön, joiden ansiosta hän on saanut japanilaisten nuorten silmissä "täydellisen tytön" maineen.
Soolouransa lisäksi Matsuura Aya on työskennellyt Hello! Projectin pienten ryhmäprojektejen parissa, kuten GAM, DEF.DIVA sekä Nochiura Natsumi, kuten myös suosituissa vuotuisissa "Shuffle-ryhmissä", jotka koostuvat Morning Musumen ja Hello! Projectin eri jäsenistä jotka "kilpailevat" siitä mikä kokoonpano myy eniten levyjä.
Vuosi 2003 toi mukaan Ayan seuraavan levyn, T.W.On sekä muutaman DVD-julkaisun. x3, hänen kolmas sooloalbuminsa, julkaistiin vuonna 2004 ja vuonna 2005 oli parhaiden 'best of' -levyn vuoro. Kokopitkien albumeidensa välissä hän julkaisi monia singlejä sekä soolona että ryhmissä joissa hän vaikutti.
Musiikkiuransa oheella Matsuura Aya on usein työskennellyt muun median parissa, kuten television, jossa häntä on voinut nähdä monessa mainoksessa. Mainoksista tunnetuimmat ovat tuotettuja Glico snackfoodsille, joka tuottaa tunnetut merkit "Pocky" ja "Pretz". Hänen muu televisiotyönsä koostuu "Utawara Hot Hit"- musiikkiohjelman juonnosta. Lisäksi hän on esiintynyt monessa pienessä televisiospotissa sekä muutamassa radio-ohjelmassa. Aya on näytellyt muutamassa draamasarjassa ja komediamusikaalissa, jossa hän myös lauloi.
Vaikka Matsuura Aya on vielä nuori, hän on ehtinyt tehnyt paljon töitä lyhyessä ajassa. Hänen uransa Hello! Projectissa jatkuu ja hänen 18. oman singlensä julkaisu on kaavailtu 1. päivälle helmikuuta, joten mitä luultavimmin hänen voittokulkunsa tulee jatkumaan!
