Atomic Tornado sai alkunsa vuonna 1992, jolloin Yo-suke Tsuchiya ja Hiroyuki Murakami perustivat oman yhtyeensä. Toimet jäivät kuitenkin tauolle 1996, yhden minialbumin julkaisun jälkeen, ja Yo-suke keskittyi toisiin projekteihin. Yksi näistä oli bändi nimeltä Lemon Glass, johon osallistui myös visual kein parissa yhtyeensä Jinkaku Radion ansiosta menestynyt Naoki.
Viisi vuotta myöhemmin oli viimeinkin paluun aika saapunut. Yo-suken seurana oli nyt uusi kokoonpano, johon kuului myös Concerto Moonista tuttu Val. Yhtyeellä oli uutta materiaalia, jota he esittivät konsertteja soittaessaan. Uudistunut Atomic Tornado lämmitteli jopa Animetalille, mutta tuoreita julkaisuja ei tullut yhtä demoa enempää ja jäsenistökin vaihteli.
2003 muodostui tuottoisaksi vuodeksi: bändiin liittyi uusi kitaristi Takashi "King" Nakayama, he saivat palstatilaa Fool's Mate -musiikkilehdestä ja lisäksi markkinoille valmistui uusi minialbumi nimeltä Tornado Eve. Atomic Tornado sai myös mahdollisuuden osallistua cover-albumille Stand Proud III, jolle he äänittivät saksalaisen power metal -yhtyeen, Helloweenin, laulun. Menestyksestä huolimatta meno alkoi jälleen hiljentyä, mitä luultavimmin epävakaan kokoonpanon vuoksi.
Vuoden 2004 lopussa yhtyeeseen esiteltiin Jack Rosessa vaikuttanut basisti Hiroyuki O-Dachi, kitaristina toimineen Yoshinao "Daxchi" O-Dachin veli. Rumpaliksi liittyi Chaly, jonka jälkeen Atomic Tornado oli jälleen kerran valmis kokeilemaan. Vuodenvaihteen jälkeen he viettivät runsaasti aikaa studiossa, säveltäen uusia kappaleita. Tämän lisäksi Yo-suke, Takashi ja Daxchi työskentelivät yhdessä muiden muusikoiden kanssa Counter Strike NEO WHITE MEMORIES- -pelin tunnuskappaleen parissa, siinä missä Atomic Tornadon fanit odottivat edelleen yhtyeensä omaa tuotantoa.
Takashi erosi Shibuya On Air Eastilla 15. lokakuuta 2005 soitetun konsertin jälkeen. Syyt jäivät hämärän peittoon ja hän on edelleen ollut mukana yhtyeen toiminnassa epävirallisissa merkeissä. Uusi kitaristi Yu-ya oli avainsana uuden aikakauden alkamisessa - hänellä oli sopimus ESP Japanin kanssa ja tämä fakta vei yhtyeen suurten tapahtumien, kuten Rock In Japanin, lavoille. Yamaha oli huomannut suosion vakuuttavan nousun ja tarjosi levytyssopimusta, millä oli varsin iloiset seuraukset: fanien hartaasti odottama uusi julkaisu olikin ensimmäinen täysipituinen albumi. Helmikuussa 2007 ilmestynyt levytys sai nimen Tornado Eye ja sitä seurasi kiertue ympäri Japania.